Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP25Q9UHP3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms