Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms