Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms