Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CCDC180Q9P1Z9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms