Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHRF1Q9P1Y6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms