Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms