Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms