Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms