Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms