Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms