Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms