Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGRNQ9NPE2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms