Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms