Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms