Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms