Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms