Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP62CLQ9H1M0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms