Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms