Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms