Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms