Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL4Q9C0H6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms