Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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