Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms