Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms