Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC8Q9BY41 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC8Q9BY41 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms