Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms