Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms