Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms