Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4K2AQ9BTU6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms