Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms