Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG101Q9BSB4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms