Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TM2D3Q9BRN9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TM2D3Q9BRN9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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