Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms