Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms