Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms