Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms