Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms