Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms