Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms