Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRBNQ96SW2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms