Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1CQ96SD1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms