Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms