Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms