Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRERF1Q96PN7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRERF1Q96PN7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms