Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP42Q96MM3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP42Q96MM3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms