Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP53Q96M91 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP53Q96M91 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms