Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms