Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227BQ96M60 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms