Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms