Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms